Nel 1991 inizia la sua carriera come Dirigente Medico Ospedaliero presso l'ex ASL di Vallecamonica-Sebino, all'interno della quale diventa nel 2002 Responsabile di Unità Funzionale Semplice di Artroscopia, dal 2009 con valenza Dipartimentale.
Dal 2012 è altresì Direttore F.F. dell'Unità Operativa di Ortopedia dell'Ospedale di Esine.
Il dottor Chitoni ha svolto anche attività didattica per la disciplina di Medicina Fisica e Riabilitativa presso la Sede di Esine e Darfo del Corso di Laurea in Infermieristica, è stato per un decennio, dal 2001 al 2010, Medico Sociale dell'U.S. Darfo Calcio.
La nomina del nuovo Direttore è un ulteriore passo che sta portando in questi mesi l'ASST della Valcamonica ad individuare nuove figure mediche in grado di sostituire personale che ha terminato o terminerà il lavoro a breve per pensionamento.